Forma arbustos o pequeños árboles que pueden alcanzar hasta 8 metros de altura; tiene ramas espinosas y un porte irregular. Las hojas son ovales-oblongas, con borde dentado, de tamaño medio grande, teñidas de rojo cuando despuntan y después de color verde oscuro. Las flores son grandes y el capullo es rojo-violado. Cuando se abren son blancos en el interior y teñidas de violeta. Se pueden agrupar en racimos en el ápice de las ramas, pueden ser hermafroditas o masculinos cuando hay el abortamiento del gineceo. La floración es continua, y los períodos principales son en primavera y otoño. 

Los frutos son grandes, oblongos y ovales y tienen una superficie lisa o rugosa y llena de prominencias. El epicarpio es espeso y la pulpa está dividida en 5-12 segmentos que contienen muchas semillas monoembrionarias. La mayor importancia económica del cedro deriva de la cáscara que es utilizada para la preparación de la fruta confitada, agua y jarabe de cedro y para la extracción de aceites esenciales. Se preparan bebidas con el zumo. En medicina se utiliza para la preparación de las infusiones. No es muy resistente a las temperaturas bajas, así que en invierno el cedro puede defoliar y recomenzar la actividad vegetativa en primavera.

Clases

Los cultivos están divididos en dos grupos: cedros ácidos y cedros dulces. Los primeros, como la especie típica, tienen flores y brotes rojos- violados y pulpa ácida; los segundos tienen flores blancas y pulpa más dulce. Entre los cedros ácidos hay el Diamante, el Etrog y la Mano de Buda (con frutos ornamentales sin pulpa); entre los cultivos de los cedros dulces hay el Corsican y el Salò.

Los así llamados limones azamboeros se pueden considerar como un híbrido entre el limonero y el cedro. Producen frutos que recuerdan el cedro por el tamaño y el espesor de la cáscara, mientras que son similares al limón por el aspecto de la planta, que es menos exigente del cedro por lo que concierne la temperatura.